Create Dockerfile

Author: briandoconnor

Dockerfile

@@ -0,0 +1,18 @@
+#############################################################
+# Dockerfile to build a sample tool container for BAMStats
+#############################################################
+
+# Set the base image to SeqWare
+FROM ubuntu:14.04
+
+# File Author / Maintainer
+MAINTAINER Brian O'Connor <briandoconnor@gmail.com>
+
+# Setup packages
+USER root
+RUN apt-get -m update && apt-get install -y apt-utils tar git curl nano wget dialog net-tools build-essential time
+
+# get the tool
+RUN wget -q http://downloads.sourceforge.net/project/bamstats/BAMStats-1.25.zip
+RUN unzip BAMStats-1.25.zip
+CMD ["/bin/bash"]