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liuxinyuan123/MIMIC_database_translation_project

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MIMIC-IV数据库汉化项目

项目背景

这是助力临床研究的一项 mimic-iv数据库 说明文档的汉化工程。

请注意: 当你看到这篇文档时,我们默认你懂得如何申请和使用mimic数据库,并且已经在正规渠道获得mimic数据库使用权限,并获得CIIT官方认证。如果不知如何申请,可通过本文件下方的官网进行检索,如有问题可联系我们。

本项目不会为你解决任何关于官方认证、伦理认证的问题,包括官网题目的答案我们将不会提供。


MIMIC数据库介绍介绍

MIMIC全称是Medical Information Mart for Intensive Care, 是一个重症医学数据库。2003年,在NIH的资助下,来自贝斯以色列女执事医疗中心(Beth Israel Deaconess Medical Center)、麻省理工(MIT)、牛津大学和麻省总医院(MGH)的急诊科医生、重症科医生、计算机科学专家等共同建立的一个数据库。

目前很多科研项目都用到了mimic数据库,但由于英文原版的说明文档阅读起来极不友好,因此,我们决定将mimic数据库的英文版说明文档进行汉化。

汉化的内容包括:

  • 英文版说明文档汉化。
  • 说明文档汉化。
  • ICD 版本汉化。

我们提供了3种说明文档,分别对应2种语言,提供中文版、英文版、中文英文对照版。


参与人员

  • 刘鑫源,青岛大学医学部,医学硕士,青岛市,山东省,中国。

  • 白洪翔,知右传感技术(上海)有限公司,软件工程师,上海市,中国。

通信方式

如需协助mimic数据库的安装(windows系统)、数据提取的sql语句,可联系以下邮件。

邮箱:17386506353@189.cn


官方MIMIC数据库的说明

官网:https://physionet.org/content/mimiciv/3.1/

背景介绍


说明文档


ICD 诊断代码手册汉化

《疾病和有关健康问题的国际统计分类》(International Statistical Classification of Diseases and Related Health Problems,简称《国际疾病分类》(International Classification of Diseases,ICD),是全世界通用的疾病分类系统和诊断工具,适用于流行病学、卫生服务管理及临床实践。ICD由世界卫生组织负责维护。ICD最初是设计成医疗保健分类系统,提供整套诊断代码来分类疾病,细项分类涵盖各种征象、症状、异常发现、民众投诉、社会环境、以及疾病或伤害的外部原因。此系统的用意是绘制健康条件的知识地图,既能对应通用类别,也能归于特定变化,并为之分配一个指定代码,长度最多为六个字符。准此,主要类别通常会包括一整组相似的疾病。

ICD诊断代码在mimic数据库中有2个版本,分别为 ICD-9ICD-10

本项目中提供ICD版本的汉化,提供了2个版本,分别为:

注意:因Gitee里面不支持过大的markdown文件的网页显示,因此本项目提供分段的ICD编码手册。


ICD操作代码

注意:因Gitee里面不支持过大的markdown文件的网页显示,因此本项目提供分段的ICD编码手册。


化验检查ID对照字典

hosp模块中化验检查ID对照字典

icu模块中化验检查ID对照字典


项目介绍

这是一个基于mimic iv数据库的一个数据挖掘相关的科研项目源代码。


软件准备

postgresql数据库16.0版本及以上。

postgresql官网下载

https://www.postgresql.org/download/


运行环境

windows 10, 64位。 windows 11, 64位。


安装教程

mimic-iv数据库安装教程: https://mimic.mit.edu/docs/

mimic-iv数据库本地安装文件: https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/

mimic-iv数据库使用教程: https://mimic.mit.edu/docs/iv/

mimic-iv数据库官网: https://physionet.org/content/mimiciv/3.1/

mimic-iv申请步骤教程: https://physionet.org/content/mimiciv/view-required-training/3.1/#1

伦理、数据使用的审批网站: https://about.citiprogram.org/

如需要安装数据库的协助,可以通过本文件下面的联系方式与本团队获得联系。


软件架构及软件准备

使用postgresql 17数据库管理。

本工程修改后的代码进行安装结束后,可在navicat、pgadmin、datagrip等主流数据库查询软件中进行数据库查询。


参与人员贡献与利益冲突声明

刘鑫源,青岛大学医学部,山东省青岛市,医学硕士,已毕业。

白洪翔,知右传感技术(上海)有限公司,软件工程师,中国上海市。

无经济与利益冲突。

通信方式

如需协助mimic数据库的安装(windows系统)、数据提取的sql语句,可联系以下邮件。

邮箱:17386506353@189.cn

交流互动

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银行账户

  • 名称:知右传感技术(上海)有限公司
  • 税号:91310113MADEJ2WB6A
  • 银行账号: 121954145810001
  • 开户银行: 招商银行股份有限公司上海嘉定支行

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MIMIC-IV数据库数汉化项目;ICD9、ICD10、ICD11诊断代码汉化项目;ICD9、ICD10手术操作代码汉化项目

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